Yüzgeçlerin ve parmakların gelişimi: balıklardan bize

  • Beş parmaklı eller, eski balıkların loblu yüzgeçlerinden, mevcut genetik programlarda meydana gelen aşamalı değişiklikler yoluyla evrimleşmiştir.
  • Hox genleri ve Shh-Gli3 yolu, karasal omurgalıların yüzgeç ışınları ve falanksları arasında ortak işlevlere sahip olup, parmakların oluşumunu ve sayısını kontrol eder.
  • Medaka, akciğerli balık ve vatozlarla yapılan çalışmalar, yüzgeçlerde "ilkel bir el" ve yüzgeçler, solungaç kemerleri ve parmaklar arasında seri homologi olduğunu göstermektedir.
  • Uzuvlardaki (kanatlar, yüzgeçler, toynaklar, eller) çeşitlilik, korunmuş olan ortak gen ağlarındaki küçük ayarlamalardan kaynaklanır.de peces Memeliler bile.

Yüzgeçlerin ve parmakların evrimi

Beş çevik ve hassas parmağıyla insan elleri, benzersiz ve neredeyse sadece bize özgü gibi görünüyor. Ancak biyoloji ve paleontoloji aynı fikirde olduğunda, büyüleyici bir fikir ortaya çıkıyor: bugün yazı yazmak, araba sürmek veya sihirbazlık yapmak için kullandığımız şey, nihayetinde eski balıkların yüzgeçlerinden türemiştir. Yüzgeçlerin ve parmakların gelişiminin nasıl gerçekleştiğini anlamak sadece bilimsel bir merak değil; en uzak kökenlerimize açılan doğrudan bir penceredir.

Son on yıllarda, CRISPR/Cas9, gelişimsel genetik ve yeni fosiller gibi teknikler sayesinde , birçok uluslararası ekip bu evrimsel bulmacayı bir araya getiriyor. Medaka ve zebra balığı gibi balıklarla, "yaşayan fosiller" olarak kabul edilen akciğerli balıklarla, farelerle ve diğer karasal omurgalılarla yapılan çalışmalar, bilim insanlarının yüzmek için tasarlanmış bir yüzgecin nasıl kademeli olarak karada ağırlık taşıyabilen bir uzuv haline geldiğini ve sonunda iyi tanımlanmış parmaklara sahip elleri oluşturduğunu yeniden yapılandırmalarına olanak sağladı.

Balıklardan dört ayaklılara: kuru toprakların fethi

Daha da geriye gidersek... 350-380 milyon yılBelirli bir soy hattı bulduk. de peces yeryüzü ortamını keşfetmeye başlayanlar, tıpkı şunlara benzer şekilde: Su ve kara arasındaki sınırı aşan balıklarBu hayvanlar bir dizi önemli yenilik geliştirdiler: bir yandan havadan oksijen çekebilen akciğerler; diğer yandan ise sığ diplerde ve daha sonra yüzeyde hareket etmeyi destekleyen sağlam yüzgeçler.

Yunanca "tetra" (dört) ve "podo" (ayak) kelimelerinden türetilen ilk dört ayaklılar bu bağlamda ortaya çıktı. Bu dört uzuvlu omurgalılar, biz de dahil olmak üzere günümüzdeki tüm amfibilerin, sürüngenlerin, kuşların ve memelilerin ataları oldular. Bugün iskeletimizde tanıdığımız temel yapı (kol, ön kol, bilek ve parmaklar), bir zamanlar yalnızca yüzmeye uyarlanmış yüzgeçlerden bu geçiş sırasında gelişti.

Zamanla, bazı balıkların kas bakımından zengin ve sağlam iç kemiklere sahip eski loblu yüzgeçleri, giderek segmentli bir uzva benzemeye başladı . İlk olarak, kol ve ön kola benzer yapılar ortaya çıktı; daha sonra, bilek ve parmakların öncüleri olarak yorumlanabilecek küçük ek kemikler belirdi. Sığ su habitatlarında, bu el benzeri "taslaklar" bitki örtüsünün arasından geçmelerine, dipte kendilerini desteklemelerine ve daha fazla kontrolle hareket etmelerine olanak sağladı.

Bu ilkel dört ayaklıların ilk "elleri" günümüzdekilerden çok farklıydı: bazı soylarda her uzuvda yedi veya sekiz parmak bulunuyordu. Günümüzde karasal omurgalıların %99'undan fazlasında baskın olan beş parmaklı yapı, yaklaşık 340-360 milyon yıl önce yerleşmeye başladı.

Paletlerden ellere: tamamen yeni bir şey değil, değiştirilmiş bir palet.

Uzun süre boyunca, elin erken dönem kara hayvanlarında yeni bir yapı olarak ortaya çıktığı varsayılıyordu . Ancak, Ulusal Bilimler Akademisi Bildirilerinde (PNAS) yayınlanan son çalışmalar bu fikri alt üst etti: el karada birdenbire ortaya çıkmadı, aksine önceden var olan bir yüzgecin köklü bir dönüşümüdür.

Şili'deki Universidad Mayor'da bulunan Bütünleştirici Biyoloji Merkezi'nden araştırmacılar, Sevilla'daki Endülüs Gelişim Biyolojisi Merkezi ve Chicago Üniversitesi ile birlikte, sırasıyla solungaçların ve anüsün yakınında bulunan balıkların göğüs ve karın yüzgeçlerine odaklandılar . Sonuçları, bu yüzgeçlerin kollarımızın ve bacaklarımızın gerçek öncüleri olduğunu ve elleri oluşturan gen ağının bu sucul uzuvlarda potansiyel olarak zaten aktif olduğunu göstermektedir.

Elin, karasal yaşamla ilişkilendirilen radikal bir yenilik olarak hayal edilmesi yerine, veriler , yeniden kullanılan ve geliştirilen eski gen ağlarından bahsettiğimizi gösteriyor . Yüzgeçten uzuvya geçiş, balıklarda zaten mevcut olan genetik programların milyonlarca yıl boyunca değiştirilmesinden, farklı düzenleyici genlerin aktivitesinin süresinin, yoğunluğunun ve yerinin ayarlanmasından oluşmuştur.

Bu bakış açısı, insanların evrimsel süreklilik içinde sadece başka bir hayvan olduğu fikriyle örtüşüyor . Genetik olarak, genlerimizin büyük bir bölümünü (yaklaşık %80) balıklarla paylaşıyoruz; bu nedenle, balıkların yüzgeçlerinin nasıl oluştuğunu incelemek, büyük ölçüde kendi biyolojimizi kökeninden incelemek anlamına geliyor.

Hox Genleri: Yüzgeçlerin ve Parmakların Ana Planı

Bu hikâyenin kilit oyuncularından biri , embriyoda organların ve uzuvların konumunu belirleyen gelişimsel genler ailesi olan Hox genleridir . Bu genler, baştan kuyruğa kadar her vücut segmentinde neyin oluşacağını gösteren bir ana plan görevi görür.

Yaklaşık 360 milyon yıl önce, Devoniyen döneminde, bazı balıklar değişen sayıda parmağa sahip uzuvlar sergilemeye başladı. Nesiller boyunca, bu erken dönem dört ayaklıların soyundan gelenler belirli bir genetik deseni "dondurdular": her uzuvda beş parmak . Büyük ölçüde Hox genlerinde kodlanan bu tasarım, o kadar başarılı ve istikrarlı hale geldi ki, karasal omurgalıların büyük çoğunluğunda korunmuştur.

Dış görünüşte insan modelinden sapmış gibi görünen türler bile bu iç organizasyonu korur. Balinalar ve deniz aslanları, parmaklara eşdeğer beş kemik ışınından oluşan iskeletlere sahiptir . Yarasalar, uçmalarını sağlayan zarlarla birleşmiş son derece uzun parmaklara sahiptir. Atlar ve kuşlarda, embriyolar beş parmak benzeri uzantıyla gelişmeye başlar; bunlar daha sonra küçülür, birleşir veya yeniden şekillenerek son derece özelleşmiş toynaklara veya kanatlara dönüşür.

2016 yılında, Chicago Üniversitesi'nden Tetsuya Nakamura'nın da aralarında bulunduğu bir grup, zebra balığı ve medaka gibi balıklarda uzuv gelişiminde rol oynayan genleri değiştirmek için CRISPR-Cas yöntemini kullandı . Bu değiştirilmiş balıklardan alınan embriyonik hücreleri farelerden alınanlarla karşılaştırarak, yüzgeç oluşumunu yönlendiren aynı Hox genlerinin karasal omurgalılarda parmakların gelişiminde de rol oynadığını keşfettiler. Başka bir deyişle, yüzgeçlerin ışınları ve parmaklarımız aynı temel "genetik dili" paylaşıyor.

Gli3 geninin ve Shh-Gli3 yolunun parmak sayısındaki rolü

El gelişimini anlamak için bir diğer önemli unsur da Shh-Gli3 (sonic hedgehog-Gli3) sinyal yoludur . Bu moleküler yol, her uzuvda ortaya çıkan parmak sayısının ince bir düzenleyicisi görevi görür. Aktivitesi azalırsa, beşten az parmak oluşur; artarsa, daha fazla parmak gelişebilir.

Özellikle Gli3 geni, önemli bir fonksiyona sahiptir: parmak sayısını beşe sınırlandırır . İnsanlarda veya farelerde mutasyona uğradığında veya inaktif hale geldiğinde, altı ila dokuz parmaklı eller ve ayaklar ortaya çıkar; bu olguya polidaktili denir. Bu durum çok nadir değildir: 500 ila 1.000 insan doğumundan birinde bir dereceye kadar polidaktili görüldüğü tahmin edilmektedir ve benzer bir durum diğer memelilerde, kuşlarda ve hatta kedi ve köpeklerde de görülmektedir.

İspanya Ulusal Araştırma Konseyi'nden (CSIC) bir ekip, Universidad Mayor ve Chicago Üniversitesi ile işbirliği içinde, prensipte parmakları olmayan balıklarda Gli3 geninin devre dışı bırakılması durumunda ne olacağını merak etti . Bunu araştırmak için CRISPR/Cas9 teknolojisini kullandılar ve 400 milyon yıldan fazla bir evrimsel süreçle dört ayaklılardan ayrılmış bir Japon türü olan medaka balığında Gli3'ün işlevini ortadan kaldırdılar.

Sonuç şaşırtıcıydı: Gli3 aktivitesi bulunmayan medaka balıkları, çok daha büyük ve daha fazla kemik içeren yüzgeçler geliştirdi . Normalde üç veya dört kemik elemanı yerine, yedi veya sekiz kemik elemanı gözlemlendi; bu durum, memelilerin el ve ayaklarındaki polidaktiliye çarpıcı bir şekilde benziyordu. Bir bakıma, bu bir "yüzgeç polidaktilisi"dir.

Araştırmacılar, moleküler ve genetik yöntemler kullanarak, balık yüzgeçlerinin ve parmaklarımızın çok benzer, ancak tamamen aynı olmayan mekanizmalarla oluştuğu sonucuna vardılar . Evrim boyunca, uzuv gelişiminden sorumlu bu düzenleyici ağlara yeni genler dahil edilerek, bugün bildiğimiz karmaşık kol ve bacak iskeleti ortaya çıktı.

Bu çalışmalar, Shh-Gli3 yolunun orijinal işlevinin yüzgeç boyutunu kontrol etmekle ilgili olduğunu göstermektedir . Bu ilkel işlev hem balık yüzgeçlerinde hem de dört ayaklı hayvanların parmaklarında korunmuştur; bu da bu iki yapı arasında daha önce düşünüldüğünden çok daha yakın, derin bir atasal bağlantı olduğunu düşündürmektedir.

Akciğer balıklarında "ilkel bir el"

Parmaklı ellerin kökenini daha da daraltmak için, başka bir araştırma grubu çok özel bir balığa odaklandı: Dört ayaklılara en yakın yaşayan balık olarak kabul edilen ve ilk dört uzuvlu omurgalılar karada yürümeye başladığında yüzen türlere benzemesi nedeniyle "yaşayan fosil" olarak adlandırılan Avustralya akciğer balığı (Neoceratodus forsteri) .

Yüzgeçleri, yüzgeçten uzuvya geçişi incelemek için mükemmel bir örnektir . Embriyogenez sırasında, bir dizi gen, şekilsiz bir öncü hücre grubunun sonunda yetişkin uzuvlarına dönüşecek olan yapıya dönüşümünü yönlendirir. Aynı genler yüzgeç oluşumunda da rol oynar, ancak bunların nasıl ve ne zaman aktive edildiğine dair evrimsel değişiklikler, balıklarda ve dört ayaklılarda farklı sonuçlara yol açar.

Ekip, akciğer balığı embriyolarındaki önemli genlerin aktivitesini analiz etti; bunlar arasında şunlar yer alıyor: hoxa13 ve hoxd13İkisi de karasal omurgalılarda "el"in gelişimiyle ilişkilidir. Hoxa13'ün, dört ayaklılarda elin kendisinin oluşacağı bölgeye çok benzeyen bir iskelet bölgesinde aktive olduğunu keşfettiler. Bu desen daha önce yüzgeçlerde hiç tespit edilmemişti. de peces Dört ayaklı hayvan soyundan daha da uzaklaşmış.

Bu bulgu , yüzgece entegre olmuş bir "ilkel elin" kara hayvanlarının atalarında zaten var olduğunu düşündürmektedir . Bununla birlikte, bu modern genetik imzayı sergilemesine rağmen, akciğerli balığın "eli", belirgin şekilde farklılaşmış bireysel parmaklardan yoksun olduğu için, dört ayaklı hayvanların ellerinin anatomisine yalnızca kısmen benzemektedir.

Bunun nedenini anlamak için araştırmacılar hoxd13 ve parmak oluşumuyla bağlantılı diğer genlerin davranışlarını gözlemlediler. Dört ayaklılarda hoxd13 dinamik olarak aktive olur: önce gelecekteki küçük parmakta aktif hale gelir ve ardından ifadesi başparmağa doğru genişleyerek beş parmağın düzenli bir şekilde ortaya çıkmasını koordine eder . Ancak akciğerli balıkların yüzgeçlerinde başlangıçta benzer bir model tespit edildi, ancak bu sonraki genişleme olmadan; gen sadece yüzgecin yarısında aktif kaldı ve parmak oluşumu için devre dışı bırakılması gereken diğer genler tipik dört ayaklı modelini izlemedi.

Sonuç olarak, bu yüzgeçlerin dört ayaklı hayvanlarda görülen el benzeri bir yapıya sahip olduğu , ancak tam parmaklı uzuvlar oluşturmak için evrimsel olarak son bir "rötuşa" ihtiyaç duydukları ortaya çıkmıştır. Bu uyum, görünüşe göre, daha sonra, tamamen karasal hayvanların soyunda gerçekleşmiştir.

Seri homologi: yüzgeçlerin, solungaç kemerlerinin ve parmakların ortak özellikleri

Yüzgeçlerin ve parmakların gelişimi, evrimsel biyolojide daha geniş bir kavram olan seri homologi kapsamına girer . Bu, vücutta ortak bir mimari "tema"yı paylaşan ancak biçim ve işlevde yerel farklılıklar gösteren tekrarlanan yapıları (omurga, parmak veya solungaç kemeri gibi) ifade eder.

Küçük dikenli vatoz ( Leucoraja erinacea ) üzerinde yapılan yakın tarihli bir çalışma, embriyodaki iki farklı hücre popülasyonunun yetişkinde aynı tekrarlayan yapıları oluşturabileceğini göstermiştir: bu durumda, çift yüzgeçler ve solungaç kemerleri, yani balıklarda ve amfibilerde solungaçları destekleyen kıkırdaklı çubuklar. Geleneksel olarak, birçok seri homologinin, evrim sürecinde bir vücut parçasının kademeli olarak diğerine dönüşmesiyle açıklanabileceği düşünülüyordu.

19. yüzyılın başlarında Karl Gegenbauer, çeneli omurgalıların çift uzantılarının (yani yüzgeçlerin ve uzuvların) solungaç kemerlerinin dönüşümü yoluyla evrimleştiğini öne sürmüştü. Bununla birlikte, modern deneyler açıklamanın daha da ileri gidebileceğini göstermektedir: Odak noktası sadece bir yapının diğerine dönüşmesi değil, aynı zamanda onları oluşturan hücreler arasında işlevsel bir eşdeğerliğin varlığıdır.

Hücre izleme teknikleri ve vatoz embriyolarına nakil yöntemini kullanan araştırmacılar, normalde solungaç kemeri iskeletini oluşturan hücrelerin gelişmekte olan bir yüzgece sorunsuz bir şekilde entegre olabildiğini ve bunun tersinin de geçerli olduğunu gözlemlediler. Bu, her iki bölgedeki hücrelerin ortak bir iskelet yeteneğine sahip olduğu anlamına gelir: "Solungaç oluştur" veya "yüzgeç oluştur" diyen yerel sinyallere benzer şekilde yanıt verebiliyorlar.

Bu tür bir eşdeğerlik, omurga veya parmaklar ve ayak parmakları gibi farklı tekrarlanan vücut parçalarının, şekilleri çok farklı olsa bile, seri olarak homolog kabul edilebilmesinin nedenini açıklamaya yardımcı olur. Benzer bir deneyde, bel bölgesindeki omurgalarla ilişkili hücreler gelişim sırasında boyun bölgesine nakledilirse, muhtemelen boyun hücreleri gibi tepki vereceklerdir; bu da bu temel yeteneği paylaştıklarını gösterir.

Diğer türler bağlamında insan eli

Bu senaryoda, insan eli artık nadir bir şey olmaktan çıkıp, ortak bir tasarımın başka bir varyantı haline geliyor . Charles Darwin bunu "Türlerin Kökeni Üzerine" adlı eserinde zaten belirtmişti: insan eli, köstebeklerin kazma ağzı, atın tırnağı, yunusların yüzgeci ve yarasaların kanadı, görünüş ve kullanım açısından aşırı farklılıklara rağmen, aynı temel kemik yapısını paylaşıyor.

İnsan elinin anatomisi son derece gelişmiştir. El ve önkolda yer alan dokuz farklı kas tarafından kontrol edilen başparmak , inanılmaz derecede hassas bir kavrama ve manipülasyon yeteneği sağlar. Karmaşık bir kemik ve bağ ağı tarafından oluşturulan bilek, el ve önkol arasında yüksek hassasiyetli bir eklem görevi görürken, sinir uçları her parmağın ucuna ulaşarak eli çevresinin gerçek bir sensörü haline getirir.

Evrim boyunca, uzuv gelişiminde rol oynayan gen setindeki (Hox genleri, Shh-Gli3 yolu ve diğer düzenleyiciler dahil) küçük varyasyonlar, muhteşem adaptasyonlar ortaya çıkarmıştır. Yarasalarda uçmak için uzun, perdeli parmaklar , atlarda işlevsel parmakları tek bir toynağa indirgeyen modifikasyonlar veya yunuslarda yüzgeçlerin güçlü itici yüzeylere dönüşmesi—hepsi aynı temel genetik "kit" ile gerçekleşmiştir.

Bilim insanları, elin belirli kısımlarını şekillendiren özel genleri belirlediler: bazıları bileğin şeklini, diğerleri her parmağın göreceli uzunluğunu, bir başkaları ise düz tırnaklar ile kavisli pençeler arasındaki farklılaşmayı düzenliyor. Bu genlerin aktivitesindeki küçük değişiklikler, unsurları kısaltmak, uzatmak veya ortadan kaldırmak için yeterlidir ; bu da makroevrimsel ölçekte, çok farklı işlevlere uyarlanmış muazzam bir form çeşitliliğine dönüşür.

Günümüzde gelişim genetiği, Darwin'in sezgisini doğruluyor: bir akbabanın kanadı ile bir aslanın pençesi arasındaki görünür farklılıklar, ortak gelişim programlarındaki ince ayarlamaların sonucu olabilir . Kadınlar ve erkekler, yarasalar, foklar, kartallar ve tembel hayvanlar, özünde aynı temel beş ışınlı uzuv planını miras alırlar; bu plan zaman içinde defalarca değiştirilir ve yeniden ayarlanır.

Bu bağlamda, neredeyse tüm omurgalıların neden tam olarak beş parmağa sahip olduğu sorusu hâlâ açık kalmaktadır. Biyomekanik hipotezler, gelişimsel verimlilik teorileri ve genetik istikrar açıklamaları öne sürülmüştür, ancak kesin bir fikir birliğine henüz varılamamıştır. Bununla birlikte, açık olan şey, günlük olarak kullandığımız ellerin ve parmakların , eski yüzgeçlerin, atalardan kalma genetik ağların ve milyonlarca yıllık evrimsel deneylerin rafine edilmiş bir ürünü olduğu ve gelişim biyolojisindeki her ilerlemenin -CRISPR/Cas9'dan akciğer balıklarındaki gen ekspresyon analizlerine kadar- bu derin dönüşümün nasıl gerçekleştiğini çözmeye bizi biraz daha yaklaştırdığıdır.

çamur balıkları
İlgili makale:
Çamur balığı: su ve kara arasındaki sınırı aşan balık

Google'da tercih edilen kaynak olarak ekleyin.